电影《在那河畔青草青》讲述卢大年（由钟镇涛饰）被姐姐安排代课去内湾，在陈素云（江玲饰）家的二楼住下。他成为了四年级忠班的班主任，面对着调皮捣蛋出了名的“三剑客”，同时也关心着因父母离婚而性格孤僻的学生周兴旺（郑传文饰）。陈素云是个文静的姑娘，与大年互相产生爱慕之情。在内湾，存在着以投毒和电击的方法捕鱼，大年决心根除这种严重破坏大自然生态的捕鱼方法，在内湾小学发起“爱川护鱼”运动，并在内湾地区推广开来。周兴旺的父亲周文（崔福生饰）经常去电鱼，为此，他受到同学嘲弄而离家出走。大年和素云要去找回孩子，最后他们能结合在一起吗？这部影片展现了在内湾发生的一系列教育和人生中的变化。从表面的学生们的调皮捣蛋到深层的家庭问题，剧情逐渐揭示了更深刻的社会问题。同时，影片通过环保主题向观众传达了保护自然生态的重要性。最终，主角们在面对困难和挑战时，也展现出了坚韧和求知的精神。